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Folding@Homeで難病解明 Part14【FAH】
- 1 :名無しさん:2020/08/07(金) 11:00:57 ID:0.net
- Folding@homeは、タンパク質がどのように自力で組みあがっていくか(folding)を
シミュレートし解明する分散コンピューティングプロジェクトです。
アルツハイマー、がん、狂牛病、パーキンソン病などはタンパク質の異常なfoldingが
原因と考えられており、foldingを解明することはこれらの疾患の解明につながります。
みなさんのコンピューターの余力を使って、タンパク質のfoldingという複雑な問題を解明しましょう。
現在、新型コロナウイルスに対抗するための解析を重点的に行っています。
■前スレ
Folding@Homeで難病解明 Part13【FAH】
https://medaka.5ch.net/test/read.cgi/pc/1592028195/
■当スレッドのチーム
チーム名 :Team 2ch
チーム番号:162
https://stats.foldingathome.org/team/162
まとめWiki
https://team2ch.net/
■Folding@Home公式
https://foldingathome.org/
- 2 :名無しさん:2020/08/07(金) 11:03:07 ID:0.net
- ■Folding@Homeの参加方法
1. アプリのダウンロード&インストール
https://foldingathome.org/start-folding/
OSは、Windows(32bit, 64bit)、Mac(macOS 10.7以降)、Linux(64bit, rpm or deb)に対応。
2. ユーザ登録
https://apps.foldingathome.org/getpasskey
名前とEmailアドレスを登録して、Passkeyを入手する。
・ユーザ登録は必須ではなく、匿名ユーザとして貢献できるが、獲得ポイントは下がる。
名前は https://stats.foldingathome.org/donors で検索して重複しないことを確認。
・名前で使える文字は、英文字、数字、下線(_)である。特に「#^?|」は不適。日本語も避ける。
3. アプリを開始して名前・チーム番号・Passkeyを登録
チーム番号に162と入力するとチーム2chのメンバーに入れる。
■関連スレ
【Team 2ch】分散コンピューティング総合322【UD→BOINC】
https://matsuri.5ch.net/test/read.cgi/entrance/1596065258/
【BOINC】自作機パワーでがん解析Ver.80【旧UD】
https://egg.2ch.net/test/read.cgi/jisaku/1544857917/
- 3 :名無しさん:2020/08/07(金) 11:03:55 ID:0.net
- ■TIPS
Q. タスクが落ちてこない
A. passkey登録する 一時停止→開始ボタン
Q. GPUが仕事しない、計算ミスる
A. クロック電圧は余裕をもった設定で
Q. CPU使用率が上がらない
A. 現時点の利用可能論理コア数は32コアです
☆高速CPU/GPUを使っていたら Next Unit Percentageの設定をしておくと良さそう
Advanced Control > Configure > Slots > (Slotを選択) > Edit > Addボタン
name に 「next-unit-percentage」、Valueに90から100の数字を入れる
デフォルトが99で、WUの処理が99%まで進んだら次のWUのダウンロードが始まるという設定。
95とかにすれば、WUの処理が終わったのに次のWUが落ちてきてない、ということを抑制できるはず。
☆標準では1つの課題にCPUの全スレッド-1(Fullの場合)を適宜割り当てて対応するようになっているが
configure→slots→Addを押して出る「CPUs」の所の数値「-1(自動割り当て)」を「1」や「2」にしてOKを押すと
CPUスレッド使用数を限定して課題を処理できる。
同時に、現在はこのスロット数を増やしている方が課題が落ちてきやすい。
(GPU側は詳しい人以外はそのままで)
☆リモートの方法
1、サブPCのAdvanced Control > Configure > Remote Access でPasswordを決める
2、IP Address Restriction に 127.0.0.1 (メインPCのIPv4アドレス)/24を入力(例:https://imgur.com/40YNkiO)
3、メインPCに戻り、Advanced Control > Clients > Add > Address > HostnameにサブPCにのIPv4アドレスを入力
4、アプリ再起動
☆コマンドラインで、FAHClient.exe --helpを実行するとオプションを閲覧できます。
- 4 :名無しさん:2020/08/07(金) 11:05:48 ID:0.net
- ■Folding@Home公式
・トップ
https://foldingathome.org/
・フォーラム
https://foldingforum.org/index.php
・FAQ
https://foldingathome.org/support/faq/
・ダウンロード/ベータ版
https://download.foldingathome.org/releases/
■ランキング
・全チームランキング
https://stats.foldingathome.org/teams
・Team 2chメンバーランキング
https://apps.foldingathome.org/teamstats/team162.html
・EOC Folding@Home Stats
https://folding.extremeoverclocking.com/
・各GPUの1日獲得ポイント表 GPU PPD Database
https://www.overclock.net/forum/55-overclock-net-folding-home-team/475163-gpu-projects-ppd-database.html
・外部の統計サイト
https://folding.extremeoverclocking.com/team_summary.php?s=&t=162
・Windows版でオプションの入力が何故か半角カナになってしまうときは、マウス右クリックのペーストを使うか、変換入力状態にしてF10で英数に変換する
・WUのDL/ULが失敗し続けて待ち時間が数十分とか数時間とかになっているのに気づいたら、いったんPauseしてFoldし直すと待ち時間をリセットできる
・とはいっても、サーバー側でWUが枯渇したり受け取り口がパンクしていると思われるので、基本的に気長に待つ
・Advanced ControlのFolding Slotsの各スロットを右クリックすれば、スロット単位でFold/Pause/Finishができる
- 5 :名無しさん:2020/08/07(金) 12:14:29.41 0.net
- 乙
- 6 :名無しさん:2020/08/07(金) 19:28:20 ID:0.net
- 乙、昨日から登録してやってます。少しでも力になれば…
- 7 :名無しさん:2020/08/07(金) 20:06:27.50 0.net
- >>6
いらっしゃい〜
がんばる仲間よ
- 8 :名無しさん:2020/08/08(土) 17:36:49 ID:0.net
- いらっしゃい
- 9 :名無しさん:2020/08/08(土) 20:28:42 ID:0.net
- 次スレあげ
- 10 :名無しさん:2020/08/08(土) 20:33:48 ID:0.net
- 少し涼しかったので、いつも通り回しますた
- 11 :名無しさん:2020/08/08(土) 20:34:24 ID:0.net
- >>6
パスキー登録してください
ポイントが増えますよ
- 12 :名無しさん:2020/08/08(土) 20:54:21 ID:0.net
- >>1Folding乙Home
- 13 :名無しさん:2020/08/08(土) 21:54:45 ID:0.net
- >>1
たて乙です(*'ω'*)
>>6
らっしゃいのんびりいきましょ( ^^) _旦~~
- 14 :名無しさん:2020/08/08(土) 23:36:01 ID:0.net
- >>11は要らないが、USBメモリでダメなのはいれといたほうがいいだろう。
見えてる地雷を踏む必要は無い。
- 15 :名無しさん:2020/08/08(土) 23:40:21 ID:0.net
- すまん。書き込んだときにスレの場所ずれてて>>14を誤爆した。
- 16 :名無しさん:2020/08/08(土) 23:41:57 ID:0.net
- . .... ..: : :: :: ::: :::::: :::::: * 。+ ゚ + ・
.∧ ∧. _::::。・._、_ ゚ ・
? (゜∀゜ ;;)(m,_)‐-(<_,` )-、 * >>15
/ 彡ミ゛ヽ .::::iー-、 .i ゚ + つまりfah専用機をIYHですね
/ :::/;;: ヽ ヽ.:::| ゝ ,n _i l どのEPYCを何個行きますか?
 ̄ ̄ ̄(_,ノ  ̄ ̄ ヽ、_ノ ̄ ̄ E_ )__ノ ̄
- 17 :名無しさん:2020/08/09(日) 09:44:40.11 0.net
- 発電所建てるところから始めても良いのよ
- 18 :名無しさん:2020/08/09(日) 10:01:28.98 0.net
- つ マイクロ水力発電
- 19 :名無しさん:2020/08/09(日) 10:15:24.00 0.net
- つ https://i.imgur.com/qxgHHIi.jpg
- 20 :名無しさん:2020/08/09(日) 11:04:50.17 0.net
- なんやこれ…
- 21 :名無しさん:2020/08/09(日) 11:20:02.10 0.net
- 室内ランニング機械で、充電って出来ないのかな?
- 22 :名無しさん:2020/08/09(日) 13:03:25.60 0.net
- >>21
どうぞ
https://image.ennori.jp/upload/images/TukaeruMain.jpg
- 23 :名無しさん:2020/08/09(日) 13:22:29 ID:0.net
- やべ、かっけー(☆。☆) ホシイ
- 24 :名無しさん:2020/08/09(日) 18:28:35 ID:0.net
- エアロバイク発電のやつ、数年前はあったけど、何であの路線ってほとんどどこも手を出さないんだろうな
- 25 :名無しさん:2020/08/09(日) 18:54:56 ID:0.net
- トレーニングマシンのバイクとかでは発電を建物の照明に使ったりという実験とか行われているらしいね。
https://forbesjapan.com/articles/detail/21461/1/1/1
- 26 :名無しさん:2020/08/09(日) 20:37:11.80 0.net
- 初めまして諸先輩方。
5月初旬からお古の部品で専用PCを作ってFolding@homeを24時間フル稼働で参加している新参者です。
1〜2週間ペースでGTX1650を1台ずつ増やして現在5台でフル稼働しています。
ソロチームでやっていますが、順位が伸び悩んだら2chチームに移籍?しようと思っております。
- 27 :名無しさん:2020/08/09(日) 21:10:41.15 0.net
- >>26
ウェルコネー!!!
このスレにはTeam2chに参加してない人だって多いですよ。
何より、トラブル対処なんかの知見が最も多く集まる場所ですからね。
お気軽に居ついてくださいませ。
(そのうち担当の方がお茶など出してくれると思いますw)
とても強力な環境を揃えてらっしゃるようでなによりです。
3か月以上も稼働させているとのことで、今更ではありますが、
F@Hで最も重要なことは「継続させること」です。
このスレの存在がモチベを保つ一助となれば幸甚に存じます。
- 28 :名無しさん:2020/08/09(日) 21:15:47.90 0.net
- >>26
しゅごい!
- 29 :名無しさん:2020/08/09(日) 22:12:11.78 0.net
- 累計100Mポイント達成したので記念パピコ
- 30 :名無しさん:2020/08/09(日) 23:00:43 ID:0.net
- >>26
ようこそチーム2chへ!
ぜひともうちの来てほしいです
自分も1650を1個もっていますが、これはPPD30万で
5台フル稼働なら、理論上PPD150万ですね、すごい
当面、順位の伸び悩みはないと思いますが・・・
チーム2chに参加しても、チーム内の順位は今までのトータルポイントで決まるので
いきなり100番以内ということは十分考えられます
- 31 :名無しさん:2020/08/10(月) 03:22:07.52 0.net
- F@hのクライアントが起動しなくなった。再インスコしてみたけどダメだった
どうしたら治るん?(´;ω;`)ウッ…
- 32 :31:2020/08/10(月) 03:31:17.49 0.net
- 個人データも削除するにチェック入れてアンインスコして再インスコしたら起動しました
お騒がせしますた
- 33 :名無しさん:2020/08/10(月) 07:31:09.95 0.net
- >>1
新スレ作成に合わせ、まとめWikiに記載されているスレタイとURLを更新しました。
- 34 :名無しさん:2020/08/10(月) 08:33:56.65 0.net
- >>33
朝っぱらから乙おつでござる!!
- 35 :名無しさん:2020/08/10(月) 10:59:54 ID:0.net
- GPUの計算ってさ、メモリの容量関係あるのかね?
- 36 :名無しさん:2020/08/10(月) 11:11:15 ID:0.net
- >>33
おつ〜!
- 37 :名無しさん:2020/08/10(月) 11:41:15 ID:0.net
- >>27
こちらこそよろしくお願いします。
>>28
ついついやっちまったなぁというかんじですw
>>30
そうなんですよね。理論上は150万PPDですが
よく行って145万PPDです。
今後はTFlops/Wの効率の良い1660Tiに入れ替えてみようと模索しています。
現況の画像上げてみます。
https://i.imgur.com/ZbaAxGs.jpg
- 38 :名無しさん:2020/08/10(月) 15:03:03.00 0.net
- ワットパフォーマンスを求め始めると最上位モデルに目がいくからほどほどにねー
- 39 :名無しさん:2020/08/10(月) 15:09:26.10 0.net
- 上位機種で電力制限かけるのが一番いいんだっけ
- 40 :名無しさん:2020/08/10(月) 15:38:50.88 0.net
- コスト考えるとどうしてもガチの最上位は高くつくから1.2段落とした辺りに電力制限入れるのが無難
- 41 :名無しさん:2020/08/10(月) 18:14:42.24 0.net
- 自分はアフターバーナーで電力70%でやっております。
60%にすると瞬間的なOCしかならないので。
- 42 :名無しさん:2020/08/10(月) 20:08:32 ID:0.net
- 2億の大台見えてきた
電気代プラス1万はちと痛いけど
テレワーク続きそうなのでもうちょい頑張る
- 43 :名無しさん:2020/08/10(月) 20:21:51 ID:0.net
- オイラの1650は、17万ぐらいしかPPDでてない。
サボリ癖ついたかww
特定宿題のせいかなぁ13420だと
どうも本気だせてない感じ。
ま、いや丁度暑いし125w前後で、エコな感じだし排熱も少ないし。
- 44 :名無しさん:2020/08/10(月) 20:36:55 ID:0.net
- >>37
Medium設定なんですね
自分の1650はfull設定でPPD30万くらいです
しかしすげーなー5個動いているなんて
俺はタイミングが良かったのか
ほとんど使っていない1650をヤフオクで12,000円で買いました
送料は1000円くらい追加しますが
- 45 :名無しさん:2020/08/10(月) 20:40:45 ID:0.net
- >>43
1650はfull設定でPPD30万くらいです
17万はおかしいですね
効率の悪い宿題にひっかかっているのかもしれません
anyからcancerに替えてみては?
cancerに変えてもコロナは来ますが、気分転換に
- 46 :名無しさん:2020/08/10(月) 20:42:57 ID:0.net
- 本格的に暑くなりましたね 夜でも暑い
GPU1つだけの稼働だけど、それすら止めたい
- 47 :名無しさん:2020/08/10(月) 22:10:25 ID:0.net
- >>45
そうなんです。
夏バテしたかなww
ちょい前まではたしかに30万前後の数値出てましたが
もうちょい様子見します。
コロナが憎いのでww集中攻撃します
- 48 :名無しさん:2020/08/10(月) 23:05:51 ID:0.net
- >>38
上を見たらキリがないですよねー。
買えるものならT4がワットパフォーマンス最高なんですけどねーw
>>44
新品を送料無料で15kくらいで買っています。なかなか値落ちしませんねー
今のマザボが5台までなのでブームが去って格安になったときに購入した
マイニング用のマザボで7枚刺しを目標にしております。
今のところ途切れなく宿題が降りてくれるので
1〜2台1660Tiを買って様子をみようかと思っています。
最上位機種買っても宿題が降りてこないと無駄で怖くて買えません(汗
>>43
自分も5台中1台が13420で18万PPDです。
1台くらいサボってもわからんだろうという声が聞こえてきそうw
- 49 :名無しさん:2020/08/10(月) 23:31:35.46 0.net
- fullとmidでGPUのスコアって変わる?
- 50 :名無しさん:2020/08/10(月) 23:32:43.12 0.net
- >>49
変わんないんじゃないの?
CPUはコア数減るから変わるけど
- 51 :名無しさん:2020/08/10(月) 23:46:54.78 0.net
- >>50
ありがとう
45がfullでってわざわざ書いていたので、自分が知らないだけで実はなんか変わるのかなって
- 52 :名無しさん:2020/08/11(火) 00:50:18 ID:0.net
- いつの間にか30Mpt行ってた
電気代以上投資は出来んからコツコツやってくよ
- 53 :名無しさん:2020/08/11(火) 00:52:53 ID:0.net
- 発電できて静かで安価なエアロバイクがあればなぁ
- 54 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:05:46 ID:0.net
- ロードバイクとクロスバイクはあるからローラー台と発電機、ギアボックスを何とか出来ればノートPCくらいなら動かせるのかな?
コロナ鍋、長梅雨、アホみたいな気温と続いて自転車乗れてない…
俺の脚力じゃ数時間続けられる出力は100Wがせいぜいだ
- 55 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:05:49 ID:0.net
- エアロバイクを1時間本気で漕ぐと、iPhoneがフル充電できるくらいの発電量らしい
PC動くんやろか…
- 56 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:31:52.85 0.net
- 昔の自転車の電球が5Wだったような記憶
- 57 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:32:21.93 0.net
- 自分の脚力ならどれくらいのマシンを動かせる とかいうスレ立てたら面白そう。
ヘタレな自分は1時間連続はとても無理なので消費電力1桁のatom搭載のノートで
バッテリーの力を借りて休み休みが限界です
- 58 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:39:22.28 0.net
- トータルじゃなく毎秒平均とかが欲しいわね
ワットチェッカー見てるとiPhone充電って5W~10W程度のはず
いつも2時間くらいはかかるから、1時間で終わるなら20W…多く見ても30W…ノートPCならいけるか
- 59 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:44:45.68 0.net
- ケーターパワーボックスのエアロバイク版があれば買うんだけどな
椅子に座ってやるのは流石に厳しい
- 60 :名無しさん:2020/08/11(火) 01:55:58.99 0.net
- >>55
3000mAhを1時間だと約10W
発電効率にもよるけどかなり辛いと思う
- 61 :名無しさん:2020/08/11(火) 07:41:47 ID:0.net
- >>57
人力飛行機設計のために必死で漕いで計測したら
1馬力(750w)もなくて途方にくれたと言う話があるからこの辺が上限になるかと
- 62 :名無しさん:2020/08/11(火) 09:40:57.90 0.net
- ここはやはり、アオヒトらの力ではなく
アマテラス様のお力をお借りするしか…
- 63 :名無しさん:2020/08/11(火) 11:03:07.67 0.net
- ソーラー発電日和だ
発電した分エアコンに回っていくけどw
- 64 :名無しさん:2020/08/11(火) 15:21:46.86 0.net
- FAHが回しているプロジェクトの詳細について
どこかで日本語で説明してくれていないかな?
まとめWikiには見当たらないんだ
- 65 :名無しさん:2020/08/11(火) 17:38:52 ID:0.net
- >>64
下記はどう?ただし内容的に古い部分が残ってる。最新情報は本家サイトだけど、
Chromeブラウザなどの自動翻訳機能を使うことで読みやすくなるかも。
Folding@home
https://ja.wikipedia.org/wiki/Folding@home
- 66 :名無しさん:2020/08/11(火) 21:51:51 ID:0.net
- スレとは関係ないけど、雨水+太陽光で発電できる時代が来るかもよ。
ttps://emira-t.jp/eq/12457/
- 67 :64:2020/08/11(火) 22:11:57 ID:0.net
- >>65
遅レススマソ。詳しいコメントさんくす
本家のサイトも見てみますー!
- 68 :名無しさん:2020/08/11(火) 22:21:14 ID:0.net
- >>65のWikipediaみました
けっこう詳しく書いてくれてるんだ
つまり、
タンパク質は、バラバラで機能しない状態から
1秒くらいでフォールディング(折りたたみ)する
タンパク質は、「折りたたみ」することで
安定して機能を発揮する立体配座状態(猫でいう
香箱座りみたいなものか)になる、と
タンパク質が、立体配座状態になるまで
きちんと丁寧に折りたたんでくれたらいいが、
途中で折りたたみミスが起こることがある
(ミスホールディング)
ミスホールディング状態のタンパクがあつまると、
色々なこわい疾患を引き起こすことになる
(続く)
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